A Engenharia Biomédica, começou com o estudo da Bioengenharia e da Engenharia de Reabilitação logo após o ano de 1945, período posterior à Segunda Guerra Mundial, para a reabilitação dos soldados feridos no conflito. Os anos se passaram e, com o avanço da tecnologia, novos equipamentos foram criados e foi necessária a criação de um ambiente adequado para a manutenção e o manuseio desses equipamentos.

Referente ao Brasil, o curso se iniciou como um mestrado em 1970 no PEB e foi criada a Sociedade Brasileira de Engenharia Biomédica. Nos anos 2000, começou a ser possível fazer uma pós-graduação na área e, apenas alguns anos depois, foi criada uma graduação, sendo um curso bastante novo em referência a outros.

A Biomedicina surgiu por volta de 1960 e, durante muito tempo, sofreu alterações em sua grade de matérias. No momento da criação, o objetivo era que os alunos formados em Biomedicina fossem professores nas áreas básicas de Medicina e Odontologia. Depois de diversas leis e decretos, o curso de biomedicina está moldado como é hoje, sendo uma das graduações que mais crescem no Brasil.

A Biomedicina tem, atualmente, o objetivo voltado para a área de pesquisa e análises de doenças relacionadas a seres humanos, focando em seu desenvolvimento e tratamento.

A Engenharia Biomédica tem como objetivo a realização de projetos, montagens e diagnósticos de aparelhos biomédicos, próteses e órteses, além da diminuição dos custos e dos riscos de um centro de saúde.

Outra diferença entre a Biomedicina e a Engenharia Biomédica é a área de atuação. Na Biomedicina, por exemplo, são mais de 20 áreas de atuação, sendo que, dentre elas, as mais conhecidas são: acupuntura, análises clínicas, análise bromatológica, banco de sangue, biologia molecular, estética, bioquímica, citologia, oncótica, farmacologia, genética, hematologia , histotecnologia clínica, imagiologia, imunologia ,microbiologia, microbiologia dos alimentos, monitoramento neurofisiológico transoperatório, parasitologia, perfusão extracorpórea, radiologia, reprodução humana, sanitarista, saúde pública, toxicologia.

Na Engenharia Biomédica, as áreas estão quase 100% ligadas à tecnologia e à pesquisa. Algumas delas são: imagiologia, bioinformática, engenharia de tecidos, tecnologia de próteses, instrumentação odontológica e médico-hospitalar, pesquisas em universidades ou setores biomédicos, manutenção de aparelhos em hospitais e centros de saúde, compra de instrumentos e materiais para os centros de saúdes e programação de softwares.